blas下载（blabberim下载）

本文目录一览：

• 1、linux关于blas、lapack的安装和使用
• 2、ScaLAPACK库安装(Linux系统)
• 3、在linux环境下安装PETSC-3.18.1
• 4、使用dbCAN2进行CAZyme注释碳水化合物酶注释

linux关于blas、lapack的安装和使用

安装BLAS和LAPACK库 推荐使用Intel MKL库：Intel MKL包含了高度优化的BLAS、LAPACK等线性代数库，适合高效运算需求。安装Intel MKL：根据Intel MKL的官方安装指南，在Linux系统上进行安装。通常这涉及到下载MKL安装包，并按照指引进行解压、配置环境变量等步骤。

安装前准备 确保系统已安装GCC和OpenMPI：GCC是GNU编译器集合，用于编译C和C++等语言的程序；OpenMPI是一个高性能的消息传递库，用于并行计算。下载并解压安装包 下载BLAS和LAPACK安装包：以0版本为例，可从官网下载或通过可靠链接下载tgz格式的压缩包。

Linux系统下，若需进行高效且便捷的BLAS和LAPACK库安装与使用，推荐选用Intel的MKL库。本文将对MKL库的使用进行实例展示，并概述BLAS、LAPACK、CBLAS与LAPACKE库的安装与配置。

第一步是下载安装包，以0版本为例，可从官网下载或通过链接下载。下载后的压缩包为 tgz 格式。随后创建新文件夹并解压安装包。解压后进入文件夹，使用 vim 打开 make.inc.example，并将倒数第4行的配置进行修改。保存退出后，执行编译命令。

ScaLAPACK库在Linux系统下的安装教程 ScaLAPACK， 作为Scalable LAPACK的缩写，是一个专为高性能并行计算设计的密集和带状线性代数库。它提供了丰富的线性代数求解功能，如矩阵运算、分解、线性方程组求解等。为了安装此库，首先需要确保你的Linux系统已经安装了GCC、OpenMPI、BLAS和LAPACK。

在Linux环境下安装PETSC11的步骤如下：下载与解压：从PETSC官网下载PETSC11的压缩包。使用tar命令解压下载的文件。环境准备：Python3：确保系统中已安装Python3，并能在命令行中调用。编译器：安装gcc、g++和gfortran编译器。MPI：可以选择下载并安装MPI，或者指定已安装的MPI路径。

ScaLAPACK库安装(Linux系统)

下载ScaLAPACK 0版本的安装包，可以从官网获取，也可以通过提供的链接下载。在你的主目录或root目录下创建一个新文件夹，用于存放安装文件。解压下载的tgz文件。如果你对tar命令不熟悉，可以查阅相关教程。进入解压后的文件夹，复制SLmake.inc.example为SLmake.inc，并进行必要的配置更改。

操作系统：64位的SuSE Linux Enterprise Server 11SP1：为用户提供标准的64位Linux操作环境，用户需提前学习Linux的基本命令行操作，尤其是文件目录操作，并熟练掌握如vi或emacs等编辑器的使用。

建议使用ScaLAPACK，先要补丁两个文件：先下载CYGWIN，把path这个环境变量里面mingw的路径替换成cygwin的路径，bash进入atlas的安装目录（就是install.txt所在的目录）然后就是直接运行。

在linux环境下安装PETSC-3.18.1

1、在Linux环境下安装PETSC11的步骤如下：下载与解压：从PETSC官网下载PETSC11的压缩包。使用tar命令解压下载的文件。环境准备：Python3：确保系统中已安装Python3，并能在命令行中调用。编译器：安装gcc、g++和gfortran编译器。MPI：可以选择下载并安装MPI，或者指定已安装的MPI路径。

2、在Linux环境下安装PETSC-11的过程对于研究大规模稀疏线性方程组求解的博士生来说是一项必要技能。我决定在虚拟机Ubuntu 02上从头开始安装，以供他人参考。首先，从官网下载并解压PETSC-11，配置过程至关重要。配置PETSC主要通过Python3脚本，确保环境中能调用Python3至关重要。

使用dbCAN2进行CAZyme注释碳水化合物酶注释

1、dbCAN2是宏基因组服务器，用于自动化碳水化合物酶注释，其相关信息包括CAZy、CAT（已过时）和Hotpep等。dbCAN2的分析步骤如下：每年更新一次CAZy数据库，提供在线注释和本地注释两种方式。

2、碳水化合物酶注释通常使用CAZy数据库。我们使用dbCAN2预测工具对碳水化合物酶进行注释。dbCAN2提供本地版和在线版，可通过网址dbCAN3 server (unl.edu)访问。这些注释方法和数据库为蛋白质功能研究提供了强大工具，帮助我们深入理解生物系统。

3、dbCAN-PUL专注于包含实验验证的原核CAZyme基因簇，这些簇能作用于碳水化合物底物，即多糖利用位点或PULs。dbCAN-PUL提供在线预测服务，用户只需上传基因组核苷酸序列即可。用户可以通过首页的Blastx功能开始预测过程。为了实现PULs的本地化，用户可以下载PUL.faa和dbCAN-PUL.xlsx文件。